Оксфордский университет и Лаборатория молекулярной биологии MRC в Кембридже представили общедоступную базу данных Unknome. Ее научная ценность заключается в том, что база содержит информацию для будущих исследований о генах, которые кодируют белки, но пока не были изучены.
Над задачей секвенирования генома человека ученые бьются давно. Многое уже сделано, однако функции большого количества белковых последовательностей до сих пор неизвестны. Причем риски игнорирования этих белков значительны, поскольку могут играть важную роль в критических клеточных процессах и обеспечить понимание принципов биохимических процессов.
Задел на будущее
Чтобы продемонстрировать, как можно использовать базу данных, исследователи взяли образец из 260 генов человека, оцененных как неизвестные. Это те гены, которые еще не изучены в достаточной степени или для них отсутствуют исследования, определяющие функции и воздействие на организм.
Затем аналогичные гены ученые нашли в геноме лабораторной мухи дрозофилы и в процессе эксперимента с помощью CRISPR последовательно отключали гены из этой выборки у развивающихся мух. В результате таких изменений большая часть мух не выжила. Это показывает, что гены, о которых ученые ничего не знают, кодируют производство критически важных белков.
Удалив экспрессию гена только в некоторых тканях мух, но не в других, исследователи смогли определить отдельные функции. Например, некоторые гены из выборки были связаны с мужской фертильностью, развитием организма и реакцией на стресс. Таким образом, ученые надеются, что их база данных станет основой для будущих исследований и генетических экспериментов, которые закроют «слепые пятна» в геноме человека.
